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qPCR 实战经验分享,让你少走弯路!

 qPCR实验中出现“十跑九跪”的情况,通常意味着实验的重复性和可靠性较差。可以自己分析下原因,这可能是由以下几个原因造成的:

  1加样操作不当:加样时的不准确可能导致实验结果的波动。这包括移液枪的准确性和加样时的技术,如果操作不当,即使是微小的误差也会导致实验结果的不稳定。吸取液体的时候,需要把枪头插入凹液面下面,而不是插到凹液面的侧面。侧面比较容易产生气泡,每次枪头不能插很深,不然,就很容易在枪头上沾上液滴,在微量的模板加样时,很容易导致加样量的误差。这个操作熟能生巧,新手们要淡定,加多了就又快又好了。

  2 预混液混合不均:qPCR预混液如果没有混合均匀,也会影响实验的重复性。确保预混液在使用前充分震荡混匀是非常重要的步骤。提前排版,采取大体积配置试剂预混 Mix 溶液,可以增加复孔的重复度,减小误差。一般会多配一些样品,这样保证最后每个孔都能有同等体积的液体;预混后要涡旋离心,使其混匀。

  3 模板DNA质量问题:模板DNA的质量和纯度直接影响qPCR的效率和特异性。如果模板DNA含有抑制剂或浓度不准确,都可能导致实验失败。

  cDNA 模板需要稀释吗?应该稀释多少倍进行定量?

  没有具体的稀释参考倍数,理论上 cDNA 每稀释 10 倍 CT 值变大 3.3,可以根据这个规律进行合适的稀释。可以使用 cDNA 原液、10 倍稀释液、100 倍稀释液等梯度稀释模板进行定量实验,根据规律选择 CT 值落在 18~28 范围内的稀释倍数。

  4 引物设计和优化:引物的设计和优化是实验成功的关键。不合适的引物可能会导致非特异性扩增或扩增效率低,影响实验结果的准确性。可以翻看下之前的引物设计篇,有详细的设计注意事项,引物设计 Primer Premier5操作详细过程-干货分享 分分钟学会

  5 荧光染料或探针的选择:荧光染料或探针的选择不当也会影响实验的灵敏度和特异性。上机前,检测下孔内是否有气泡,若存在气泡需轻轻弹去,不要在管口对准的管盖部分做标记,影响荧光信号采集。


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